万石莲寺位于“万笏朝天”巨石的下方，由于寺周多巨石，故得此名。它相传为唐代开元年间中原陈氏入岛开发时所建，是厦门岛上最早的寺庙之一，距今已有1000多年的历史了。后来几经兴废，重修了几次。现在这个样子是厦门开放后由新加坡佛教总会会长宏船法师重修的。
从山下到万石莲寺需经海会桥，过海会桥后为山门，拾级而上，迎面为石坊，石坊上的楹联“一句弥陀声传鹭岛，千年常住业绍庐山”，是弘一法师为会泉法师中兴万石岩而写的。石坊内是主殿大雄宝殿，殿内有万石莲寺把奉的西方三圣的佛像，因而此地又叫“小西天”。大殿左侧有洞门可入，走过洞门就是会泉法师的纪念室，再后面就是念佛堂，堂匾是弘一法师所写，当年弘一法师就是在此讲经的。纪念堂前，有块巨石一“聆妙石”，石上龙须虬根，蟠石而生，榕叉里又有一株寄生树，这就是树包石、树包树的奇特景观。“聆妙石”对面还有一块巨石，有石步可以攀登，登上石顶可览植物园西半园主景、远眺市区的繁华。
地址：厦门市思明区虎园路25号厦门园林植物园（万石植物园）内
类型：寺庙
游玩时间：建议1小时
电话：0592-2022159
开放时间：
春夏（5月1日-10月7日）5:30-18:30，秋冬（10月8日-次年4月30日）6:30-18:00。
门票信息：
无需门票。包含在厦门园林植物园（万石植物园）门票内