福安市瓜溪桫椤省级自然保护区于1996年3月经福安市人民政府批准成立，1999年2月经福建省人民政府批准，确定为省级自然保护区。1999年5月经福安市编委批准成立管理处，2011年12月经宁德市编委同意，确定福安市瓜溪桫椤省级自然保护区管理处为财政全额拨款的事业单位属我局管理的副科级事业单位，下设办公室、保护股等2个办事机构，核定财政核拨事业编制6名，管理处设立瓜溪、铜坑里两个护林检查哨卡。保护区管理处成立以来，瓜溪桫椤自然保护区管理得到加强，实施了保护区基础设施建设项目，并着手对保护区内的核心区和地质灾害点民房实施整体搬迁，有效保护了桫椤的自然生长环境。
保护区地处福安市西南部，位于福安市溪潭镇和甘棠镇交界处，地理坐标为：东经119°31′10″～119°33′06″，北纬26°59′10″～26°56′23″，涉及2个镇7个行政村36个自然村，816户，总人口3613人，面积1438hm2，森林覆盖率达77.29%。大面积的森林孕育了丰富的中亚热带生物多样性，优势树种以壳斗科为主，天然分布有常绿针叶林、针阔混交林、灌丛、草丛和竹林等6个植被类型，共138科322属436种。特别是保护区内不仅孕育几千株不同树龄、大小不等的刺桫椤，而且还有高达7.5米、胸径达19厘米的“刺桫椤王”，刺桫椤分布于北纬26°58'，其纬度之高，全国少有，尤其在约400公顷范围内，分布有4000多株古生代志留纪和下泥盆纪昌盛一时的裸蕨植物——桫椤，面积大，数量多，这在我国极为罕见。
保护区内植物种类繁多，风景优美，有夫妻瀑，葫芦瀑、红军潭、鸳鸯潭和水帘洞等自然景观，是闽东乃至全省生态旅游的一大亮点。良好的栖息环境为野生动物生存提供了可靠的保障，区内蕴藏有陆生野生脊椎动物27目54科157种，其中兽类8目15科23种，占福建省兽类总种数的20.9%。鸟类14目27科71种，占福建省鸟类总种数的13.1%。爬行类3目8科14种，占福建省爬行类总种数的12.2%。两栖类2目4科6种，占福建省两栖类总种数的12.2%。淡水鱼类38种；昆虫纲9目45科203种。其中；国家Ⅰ级保护动物有云豹、白颈长尾雉、蟒蛇等4种，国家Ⅱ级保护动物有穿山甲、大灵猫、大鲵、鬣羚、鸳鸯等14种。