博尔塔拉蒙古自治州博物馆是一家综合性博物馆，成立于1984年5月，座落在新疆博乐市南城区。
博物馆主体建筑座北朝南，后面是一座栽满风景树的小山，南面是一个面积20万平方米的生态广场，与博州综合体育馆南北相对，其建筑风格充分体现了蒙古族文化特色，外观由三个蒙古包组成，中间一个大蒙古包为金色大帐，两侧各设一个小蒙古包，框架三层，局部四层。
博州博物馆与州文管所属两块牌子一套人马。博物馆成立以来先后经历了三次搬迁，1984-1996年在原州总工会展厅先后举办了自治州成立30周年、40周年大庆成果展、文物保护图片展和小型馆藏文物与图片展；1997-2007年，在州文化综合楼举办了博州民俗、历史文物陈列；2005-2007年，州党委、政府自筹资金2146万元建成博物馆新馆，2008年10月，博物馆搬入新馆。
2018年9月，经中国博物馆协会决定同意博尔塔拉蒙古自治州博物馆为国家三级博物馆。