中国药科大学中药标本馆坐落在南京燕子矶脚下的中国药科大学校园内。这里的建筑皆依山而造，布局错落有致，颇有中国园林建筑的独特风格。校园内花木扶疏，药圃葱郁，绿草如茵，一派迷人的南国风情。
中国药科大学是我国最早独立设制的药学高等学府，原为1936年始建的国立药学专科学校。1986年10月，学校改称现名后，随之在原药用植物标本室和原生药标本室的基础上，正式建立中国药科大学中药标本馆。
中药标本馆由生药标本室、药用植物标本室和综合展示室三个部分组成。生药标本室内，存放着经几代学者多年收集、鉴定的生药标本。其中既有野山参、鹿茸、犀牛角、虎骨、牛黄、马宝、猴枣、羚羊角、麝香等名贵药材，也有数千种不同产地、不同时间的常用中药材；市场出现的多种假冒药材，这里也有专柜存放，为中草药鉴定、辨伪提供实物材料。另外，中国药科大学获国家科技进步一等奖的攻关项目《常用中药材品种整理与质量研究》所涉及20多个专题的药材标本，也完整地保留在生药标本室，有着很高的研究收藏价值。
宽敞明亮的综合展示厅，陈列着本世纪三、四十年代德国E.Merck公司制作的国外生药标本300余瓶。长沙马王堆一号汉墓考古出土的部分药材也在这里展出，数量虽不多，但是馆内藏品中历史最长的药材标本。此外，常用中药材粉末鉴定标本、常用中草药饮片标本、香港有毒药材标本、名贵中成药样品、常用矿物、动物药材标本等也济济一堂。综合展示厅内的展品，从矿物、植物到动物，从地下部分到地上部分，从整体到局部，从饮片至成药，无不使您感受到我国中医药文化渊源流长、博大精深。
药用植物标本室内有6000多种腊叶标本，按恩格勒分类系统有序的排列在标本柜中。在众多的展品中，有1880年美国采集制做的腊叶标本，本世纪初前苏联采集制作的腊叶标本、同越南、朝鲜、日本等国交换的腊叶标本、建校初期采自峨嵋山的数千份药用植物标本以及采自黑龙江大兴安岭、内蒙古、西藏、新疆、西双版纳、海南等边远地区的珍贵药用植物标本。
在中药标本馆旁，还有始建于1958年的药用植物园和栽培温室。植物园占地40亩，栽培着药用、观赏植物1000多种。浓密的树荫下，幽静的小道旁栽满了各种名称、各种功用的中草药。这里有高大的木本、缠绵的藤本、羞涩的蕨类、低矮的灌木、形态各异的草本等。造型别致、四季如春的大型温室，栽培着多种热带药用植物和珍稀观赏花卉，有很高的研究和观赏价值。
作为中国药科大学重要的科教基地，同时也作为“全国高等学校博物馆学会”和“全国中医药院校标本馆专业委员会”的常务理事单位，中药标本馆不仅在中草药鉴定、中药泡制、植物资源利用、中药标本馆建设等方面进行了深入而广泛的研究，还同美国、英国、日本、意大利、加拿大、瑞典等30多个国家和地区开展了广泛的科研交流与合作，博得了国内外同行的一致好评。
中医药文化是中华民族的国粹，是古代劳动人民利用天然药材同疾病斗争的智慧结晶，有着几千年的发展史。随着社会的科技进步，对利用天然药物也愈加重视。中草药疗效确切，毒副作用小，再加上中医药独特的养生保健内涵，这使得中药标本馆每年都吸引了大批国内外学者、大中小学生、旅游者前来参观学习，以了解历史悠久的中医药文化和养生保健之道。1997年该馆被南京市教委定为中小学科普教育基地。