武庙遗址位于玄武区北京东路43号，时代为明、清。
明初，在今南京市委大院东侧的武庙，为明代十庙之一，祭祀武夫子关羽，其规模宏大，殿宇轩然，不仅有大成殿三间，还有东西斜廊各五间，露台高阔，前有大成门，棂星门三座等。直至清兵南下，士子星散，改国子监为江宁学府。此后，嘉庆年间，横遭火灾，咸丰年间又罹战火，遂于1867年同治六年移江宁学府于冶城，今天的朝天宫。历时480余年具有广厦千间，巍巍殿宇的国子监再次横遭不幸。同治八年1869年，复移武庙于园内东侧，据《钟南淮北区域志》：“山（鸡笼山）东麓有夫子庙，明为国子监，清为纪念府学，同治迁府学于冶山，即其地作武庙。”现市委大院东部南京政协所属地域的武庙仍保持完好。
武庙遗址为南京市文物保护单位。