现为省级文物保护单位，位于市区北河下25号。始建于清同治三年（1864年），同治十二年（1873年）上海法籍神父来扬聘请扬州工匠建造，教堂坐西朝东，占地面积2080平方米，建筑面积1302平方米。大门为中式水磨砖砌门楼，上嵌石额，刻“天主堂”三字。教堂为中世纪哥特式建筑，两坡顶，屋尖竖铜十字架，正立面有三拱门，两侧有钟楼。堂内用簇柱，窗户镶嵌彩色玻璃，装修精致华美。教堂以南有北向神父楼一座，保存完好。为古运河旅游线上的重要文物古迹，现用作宗教活动场所。
1995年4月，扬州天主教耶稣圣心堂被公布为第四批江苏省文物保护单位。