兰溪药皇庙位于兰溪市云山街道，年代为清。
牛角尖雀门巷23号，就是药皇庙。药皇庙共三进，占地1100平方米。前有砖雕门楼，上 书-“药皇庙”三字，正殿面阔五间，梁、檩、枋、牛腿等构件，皆雕刻大量人物、花卉和鸟兽等图案，供奉祖师神农。
根据道光三十年（公元1851年）立的《重建瀫西药业公所碑记》记载，早在乾隆九年（公元1744年），当地的徐公质亭、汤公制菴两人倡议捐资建庙于邑城之三坊，之后，兰溪又建起了瀫西药业公所。
1996年10月3日公布为兰溪市级文物保护单位。
2017年1月13日，浙江省人民政府公布为第七批浙江省文物保护单位。