玉峰遗址位于玉峰山西山南，因在玉峰山附近发现而命名为玉峰遗址,为新石器时代古人类活动文化遗址.遗址面积1000平方米，中部圆形土台高出地表7.8米，面积约366平方米。1992年11月修筑公路取土时发现。采集到大量马家浜文化红陶片、黑陶片、灰陶器残片，崧泽文化黑皮陶片、灰陶片和良渚文化石斧、石锛共11件，现存部分高地。2004年7月公布为昆山市第三批文物保护单位。
据了解，玉峰山、绰墩山、赵陵山、少卿山、黄泥山、太史淀等地均留有远古先民印迹。6500年前，东海海面有一次波动下降的过程，海水东退，海平面比现在低于3~4米。那时候，昆山的先民从地势较高的马鞍山南麓(玉峰遗址)逐渐向绰墩山等靠近湖泊的地区转移，开始了定居生活，玉峰遗址是昆山原始先民最早生活的地方。