马桥古文化遗址(MaqiaoGuwenhuaYizhi)位于闵行区马桥镇北竹港和俞塘汇合处西北侧。面积约5000平方米。1959年发现，1960年、1966年两次发掘。出土石、玉、陶、骨、铜器等文物500余件，是太湖地区早期印纹陶文化的典型遗存。1982年定名为“马桥文化”。遗址的发现证明了4000多年前这里已有先民生息，为研究上海史和中国东南地区古文化、南北文化的相互关系和影响提供了实物材料和科学依据。1977年被列为市级保护地点。
马桥遗址是迄今已知最大的含马桥文化内涵的遗址，1993－1997年的发掘获得了丰富的资料。本项研究系统、完整地整理、发表了这批资料，其中包括新石器时代良渚文化遗存、夏商时期马桥文化遗存和春秋战国至宋元时期遗存，以马桥文化遗存最为丰富。出土了各时期的陶瓷器、石器、骨角器、青铜器等，还出土了大量的动物遗骸，并且通过采样分析获取了其他的自然遗存。对发掘出土的文化遗存和自然遗存从不同角度作了深入细致的考古学、微体古生物学、动物学、植物学、硅酸盐等多学科研究，另外还对良渚文化和马桥文化墓葬人骨作了DNA分析。对马桥遗址和马桥文化全面深入的研究，其成果是迄今为止最翔实的马桥文化遗址发掘和研究报告，完整地公布了所发现的文化遗存和自然遗存，发表了最新的研究成果。马桥发掘报告不仅能使学术界能够比较全面地认识马桥文化，推动环太湖地区古代文化研究的深入，而且还有利于夏商时期中原与周边地区文化比较研究工作的开展，对探讨长江流域文明化进程具有重要的意义。
2013年5月，被国务院核定公布为第七批全国重点文物保护单位。